寄生虫一直是影响肉驴健康的头号杀手，驱虫对于肉驴的生长十分重要，养殖户可以关注以下两点：
做好驴舍卫生工作寄生虫以及虫卵可藏身于驴舍粪污或缝隙内，要保持驴舍的干净卫生，养驴户们应及时清理舍内粪污，可将其运送到距驴舍较远的区域堆积发酵和杀菌。另外，还要定期对驴舍进行消毒处理，消毒时注意不要留下消毒死角。
切断传播途径寄生虫可以通过猫、狗等进行传播，因此养驴场应尽可能不要养狗、猫等动物，另外需要做好灭鼠、灭蚊蝇等工作。
一般来说，正常舍饲的肉驴可在春秋两季分别驱虫1次，另外由放牧改为圈养。而肉驴常发生的寄生虫疾病主要有疥螨、蛲虫、丝虫，在预防计划的制定方面，一定要注明用药标准。
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