一是检测肥料中的缩二脲含量是否超标。如果缩二脲超标则会引发烧苗、烧根。缩二脲来源于尿素，合格的尿素其缩二脲含量是达标的，不会产生“肥害”，而复合肥氮养分来源进行二次加工时，在高温状态下，如果工艺操作不当，就会重新产生缩二脲，从而导致“肥害”发生。特别是目前出现了一些新的复合肥造粒技术，如高塔熔融喷浆造粒、转鼓喷浆造粒等工艺，若控制不当，极易引起缩二脲超标。
二是重金属污染也是引起植物烧苗、烧根的重要原因之一。目前市场上流通的高浓度复合肥存在重金属污染的可能性较小，而低浓度复合肥则概率较大。但近年来一些厂家为了差异化营销和制造产品卖点，会在复合肥中添加一些中微量元素，可能会带入重金属。另外，在高浓度复合肥中，如使用了来路不明、质量不合格的钾肥作为原料，也很可能引起重金属超标。还有些复合肥企业为了应对市场竞争，还有可能在产品中添加隐性成分，以便让产品能达到更好的使用效果和市场反馈，这些隐性成分在有些土壤中也许能产生正面效果，而在其他环境下则很可能引发“肥害”。
三是检测氯离子是否超标。一方面忌氯作物如果使用了含氯肥料，毫无疑问会产生“肥害”；另一方面即便不是忌氯作物，如果氯离子浓度过高同样会产生盐害，引发烧苗、烧根等问题。氯离子超标引发的“肥害”与土壤和气候密切相关，如果天气干旱、土壤墒情低，大量的化肥施入土壤后极易发生盐害，特别是对于双氯型复合肥而言（指复合肥原料来源于氯化铵和氯化钾），这一问题尤为突出。目前此类危害在淮河以北的干旱地区较为多发。
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