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DNA身份鉴定:解密品种“黑匣子”

2015-08-06来源:农民日报
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编者按 针对目前我国农作物品种身份鉴定手段落后、套牌侵权、珍贵种质资源流失等问题,农业部办公厅于近日印发了《农作物品种DNA身份鉴定体系构建实施方案》,将在已有种质资源库基础上,构建全国统一的品种DNA信息数据库及品种身份查询平台,实现品种身份可鉴定、信息可查询、资源可保护、材料可流通、成果可交易、种子可追溯。品种管理的DNA鉴定模式由此开启。

给种子做个“亲子鉴定”


●DUS田间表型鉴定是对申请保护的植物新品种进行特异性、一致性和稳定性的栽培鉴定试验或室内分析测试的过程。测试方法是将申请品种与近似品种在相同的生长条件下,从植物的种子、幼苗、开花期、成熟期等各个阶段对多个质量性状、数量性状及抗病性等作出观察记载,并与近似品种进行结果比较。

●DNA室内基因型鉴定是一项生物学检测技术,以玉米为例,玉米有总数约为30亿个碱基对的DNA,每个品种的DNA都不完全相同,品种与品种之间不同的碱基对数目达几百万之多,因此通过分子生物学方法显示的DNA图谱也有差异,由此可以识别不同的品种。

如果将100个品种撕掉标签和包装,通过种子形态或者田间种植进行形态观察让它们一一对号入座,辨别出分别是什么品种,我想几乎没有人能够做到,那成千上万个品种就更不可能做到了。但利用DNA指纹技术识别这些品种就轻而易举了,一天就可以完成。“这就是DNA鉴定技术既准确可靠,又经济快捷的优势。”北京市农林科学院玉米研究中心主任赵久然的信心来自于他们团队20余年持之以恒的关于玉米标准DNA技术的研究与应用。

农业部办公厅日前发布了《农作物品种DNA身份鉴定体系构建实施方案》,明确了农作物品种DNA身份鉴定体系构建的重要意义和发展方向。

且说快和准

难以想象仅2014年一年时间里,玉米中心做过的DNA指纹检测鉴定样本量达1万多份。“正常程序是7个工作日之内出结果,加急样品48小时内出结果。”检测中心王凤格博士说,“无论是已审定的、参加过区试的,还是提交品种权保护的品种,凡是在玉米中心做过检测的,其‘指纹’和痕迹就会永久留存了。目前,这个标准指数库已经保存了2万多个玉米标准DNA指纹信息,未来还会进一步扩容。”

人类DNA鉴定技术的应用也有近20年了,通过人的DNA检测可以进行亲子鉴定,更可以用于刑事侦查中的DNA比对,已经成为公安机关有效的破案利器。作物与人都属于生物,遗传信息载体都是DNA,很多技术是相通的,但也有不同之处。赵久然解释,在人类DNA检测结果判别上,引入最大似然率概念,就是说两个样本的DNA鉴定结果完全一样,也存在着极小概率不是同一个人的可能性。而在玉米品种判定中,没有使用“最大似然率”这个概念,采用了“高度近似”这个概念。就是说如果两个品种的DNA鉴定结果相同,其判定结论是“相同或高度近似”,有可能不同,但即使有些许差异,这种差异也是很小的,顶多属于派生品种范畴。如果把两个品种种在一起,连育种者自己都分不清哪个是他育成的品种,还能说那是一个新品种吗?“同”是相对的,“不同”是绝对的,没有两个绝对相同完全一样的事物,关键是确定和把握好尺度。

遏制“仿冒套”

有人说“市场上至少1/3的种子是假冒的。”有人感慨“新品种培育六七年,仿冒才几天。”业内认为“仿冒套”伤的是种业创新力,呼吁通过DNA身份鉴定这项技术支撑,能够对“仿冒套”起到遏制作用,鼓励真正的品种创新,引导市场走向自律。

人靠相貌等可以辨别,而DNA鉴定是最终途径。农作物也是一样,由于少数具备高产、广适、抗病等特性的亲本被集中应用,在原品种基础上稍作修改的派生品种越来越多,品种间的遗传差异是肉眼所难以辨别的,这时就需要DNA来鉴定其身份了。

例如山东济南中院受理先锋公司告某公司生产的“费玉3号”侵犯“先玉335”品种权案,经玉米中心DNA检测,“费玉3号”与农业部“先玉335”标准样品比较,在40个位点上位点差异为1,被告未提出有利证据证明不是同一品种,判决被告停止侵权并赔偿原告经济损失。

“依据玉米DNA指纹检测标准,如果差异位点数≥2,证明为不同品种;差异位点数≤1,则证明品种相同或高度近似。”赵久然说,“这其中是留有框量的,但是基本不给‘仿冒套’钻空子的余地。”

不是随便“抓一把”

玉米有30亿个碱基对,凭什么仅靠目前的40个位点检测结果,就能判断清楚?

对此,赵久然说,这40个位点不是随便“抓一把”。2001年起确立了核心引物组合法的品种鉴定方案,从2001年~2005年,经过4年多系统筛选和重新设计,形成了一套共40个位点适于玉米品种鉴定的SSR(简单重复序列)引物组合,这些位点都存在等位基因,在不同品种间存在着明确的差异,这些差异组合就可以组合出巨大的天文数字。在此基础上研制出国内首个和唯一的适合玉米品种真实性检测的的DNA指纹复合扩增试剂盒专利产品。利用这套引物,仅玉米中心就开展了近5万份样品的真实性检测,充分检验了40个引物的有效性。

SNP(单核苷酸多态性)技术是否就此取代了SSR技术在DNA身份鉴定测试中的应用?

“实际上是推广一代,研究一代。”赵久然说,每种标记技术都在特定时期内对品种检测工作发挥一定作用,其中SSR和SNP由于均为共显性遗传、染色体定位清楚、具有高通量自动化的潜力而被UPOV的BMT分子测试指南推荐作为品种鉴定和数据库构建的优选标记。赵久然认为,两种标记技术均是比较适合品种指纹分析的标记,其中SSR标记可以满足大部分样品快速低成本的进行真实性检测的要求,而SNP标记可以对其中鉴别困难的派生品种进行精细鉴别,两种标记技术各自具备优缺点,可优势互补,未来将长期并存应用。


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[责任编辑:zhangxuqin] 标签: DNA身份鉴定 品种“黑匣子”
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