自2014年6月11日陆丰市人民法院受理该案件，在多次审理过程中，经陆丰市人民法院主持调解，各方当事人最终自愿达成了协议。陆丰市人民法院民事调解书（【2014】汕陆法民二初字第54号）显示，由被告陆丰农盛补偿给18名原告共计324.02万元，共分两期直接支付给原告，第一期于本协议鉴订之日支付一半，第二期于2015年9月15日前支付。其中，106.36万元补偿款由陆丰农盛直接支付给陆丰市农业局，作为原告还其于2014年5月16日向陆丰市农业局借到的紧急回复农业生产款。
被告世农种苗有限公司基于“扶农、助农”的原则补偿“CR世农301”萝卜种子11926罐给被告陆丰市农盛，补偿的种子于2015年12月31日前供给原告。
对于这个结果，受损农户认为是出于对吴汉权的同情，也不想因一直打官司而耽误农活。碣石镇种植户吴少豪说：“已经领到了300元/亩赔偿金。他（吴汉权）老婆关了那么久，我们也给予同情，不想把人家逼那么死 。也不想一直打官司，太久影响干农活。这也是大家（受损农户）的意见。”
在公开审理间歇时的讨论场景
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2014年4月，广东陆丰种植的“世农CR301”萝卜近5000亩出现抽薹开花，农民损失近千万元，农财宝典记者深入一线采访，5篇报道持续跟进，从错纵复杂的利益纠葛中理出线索，逐渐还原事件全景真相。
2014年5月，陆丰市政府垫付133.76万元助农复产，陆丰市农业局种子管理站两名工作人员被行政处分，经营无商标（白罐）种子的陆丰市东海春城蔬菜种子经营部的老板林春城被判刑3年，“世农CR301”经销商（陆丰市农盛种业有限公司）陈秀良被拘留。
2015年3月4日，广东陆丰市萝卜抽薹开花案在陆丰市人民法院第四法庭公开审理。原告和被告双方代表及其原被告双方代理律师出庭。在上午和下午的法庭调查阶段，原被告双方代理律师交换证据，双方进行了长时间的举证和质证。据悉，双方已经于2014年12月17日进行了第一次交换证据，并与2015年2月5日在法庭进行了调解，因个别赔偿无法达成，调解没有达成，于是在3月4日法院进行了公开审理。
■陆丰萝卜开花案件系列报道
《陆丰4570亩“世农CR301”萝卜抽薹开花，目前预计损失914万元》
《24名大户代表向政府递状求公道》
《陆丰两名种子站人员疑参与售种被查》
《1人刑拘 2人被起诉3人被立案问责》
《政府垫133.76万元助农复产》
《陆丰萝卜开花案引发种业界热议》
《“世农CR301”萝卜种纠纷：扯开了种业的疤》
《采访手记“拔萝卜”的经过》
