入库保藏种子，除了要求种球含水量低于15%外，还要求种子库内有一定的低温和低湿环境。
种子仓库选建在地势高、地下水位低的地方，库内地面最好用木结构，并有通风和防鼠设施。如在砖地或水泥地上堆放种子，堆底要垫木材约70厘米高，最好先铺层油毯纸，再盖一层席子。
种子的堆放，目前普遍用尼龙袋装种子保藏。种子袋的堆积高度应根据气候条件而定，一般堆高5-7米，堆宽以3-5个袋的宽度为一垛，每垛间留30-40厘米的风道。每两垛间有一条宽1米的人行道。也可以采取散装保管种子，一般以1-2米为宜。种子堆中要装置通风筒，每4-5平方米设一个，筒孔直径20厘米左右。管理人员要择优选择对工作具有高度负责人员担任。做到腿勤、眼勤、手勤。发现问题及时排除，种子库要设台账和登记卡片，详细记录种子品种、种类、数量、采种并作生产地点等方面内容。库内应根据不同品种、年份、分别堆放。并要进行温度、湿度的观测。在多湿润雨季应每日观测1次，其余季节可每3日观测1次。种子库每年应抽查种子2次，以便采取通风、调温、防鼠、治虫等措施。真正做到万无一失，使甜菜种子按标准出售给种植户。
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