通过对SCI论文的发文量变化趋势、重要发文国家和机构，以及研究主题、被引频次等进行分析，揭示作物育种领域学科发展态势，为明确我国作物育种研究重点和产业发展方向提供参考。本研究数据来源于汤森路透公司的SCIE数据库，分析时间范围为2005年至2014年。
1.发文量及年度变化趋势
作物育种领域发文量自2005年到2014年呈现稳步上升的趋势，由2005年的2843篇增长到2014年的6547篇，平均年度增长率为7.8%，表明作物育种研究作为一个成熟的学科一直在稳步发展之中。中国在作物育种领域的发文量一直保持快速增长趋势，其他国家则处于相对平稳的状态，中国自2011年开始超越美国成为作物育种领域发文量最多的国家，由此也可以说全球作物育种领域发文量的稳步增长很大程度上是由中国在作物育种领域研究发文量的增加引起的。（见图1）
图1 作物育种领域2005-2014年度发文量变化趋势
2. 重点国家发文量对比分析
2005-2014年度作物育种领域发文量排名前10的国家依次为中国、美国、日本、印度、德国、巴西、韩国、澳大利亚、西班牙和法国，其中中国的发文量最多为10079篇，美国为9422篇。发文量前10的国家占整个作物育种领域发文量的71%，而中国更是占到了作物育种领域全部发文量的20%。
从作物育种领域主要国家发文量及其平均被引频次分析可以发现：中国发文量虽然最多，但单篇平均被引频次为10.3，处于10个国家的中等水平。单篇平均被引频次最高的为英国26.1次，美国单篇平均被引频次为19.6，无论是发文数量和质量均处于优势的地位。我国应在提升研究水平的同时，更注重发文质量的提高。
3.国际重要机构发文量对比分析
作物育种领域2005-2014年发文量排在前20的机构有美国农业部、中国科学院、中国农业科学院等。这20个机构中有中国7家，美国5家，日本2家，法国、西班牙、加拿大、澳大利亚、巴西和德国各1家。
从平均单篇被引频次看，最高的康奈尔大学为32.2次，其次是加州大学戴维斯分校为28.5次，排名第三的澳大利亚联邦科学与工业研究组织为25.8次。中国科学院平均单篇被引频次最高为17.0次，其后依次为华中农业大学、浙江大学、山东农业大学、中国农业科学院、中国农业大学和南京农业大学。
4.高被引论文分析
通过对作物育种领域2005-2014年度的高被引论文进行分析可以发现作物育种领域研究热点的变化趋势。研究表明，作物育种领域的研究热点如下：在植物基因组研究方面涉及大豆基因组、水稻基因组、葡萄基因组、番茄基因组序列阐释肉质果实演化、超高密度遗传图谱构建、群体遗传分析、群体GWAS分析等；在植物应激研究方面包括作物耐非生物胁迫的抗氧化机制、基因网络参与干旱应激反应、超表达NAMATAFCUC(NAC)转录因子增强水稻抗旱耐盐性、耐热植物等方面；在DNA修饰方面涉及基于TALEN和TAL效应子DNA靶向敲除技术、植物基因微卫星标记、DNA甲基化技术等方面；在植物病害方面包括植物的诱导防御相关蛋白等；在植物生长代谢方面有细胞分裂素氧化酶调节稻米生产、基因敲减技术活化p53蛋白等。其中单篇最高被引频次为1019次，为美国HudsonAlpha基因组测序中心等机构发表在Nature上的“Genome sequence of thepalaeopolyploid soybean”。该研究完成了大豆的完整基因组序列草图，结合物理图谱和高密度遗传图谱，获得了大豆基因组的序列拼接草图，精确的大豆基因组序列图谱将为更多的大豆性状遗传基础的鉴定提供便利，并加快大豆品种改良的步伐。
5.基于文献共被引关系的研究主题分析
利用citespace软件对作物育种领域研究数据集进行主题聚类分析，结合词频共现（TFIDF）、对数似然比（LLR，log likelihood ratio）和互信息（MI，mutual information）三种方法进行分析，研究发现，研究热点主要集中在4个方面：（1）植物转基因的表达、过表达，农杆菌介导的遗传转化等；（2）围绕作物数量性状位点、分子标记辅助选育、基因连锁图谱等技术开展研究；（3）围绕基因多态性、微卫星标记、简单重复序列、SSR标记等技术特征或技术展开的相关研究；（4）围绕作物抗性，如耐盐碱、抗旱等非生物胁迫，以及脱落酸如何在其中发挥作用等相关研究。（详见图2）
图2作物育种领域2005-2014主题聚类
通过分析引用高峰的文献，可以发现作物育种领域研究热点随时间的演化。2005-2007年间研究热点集中在粳稻、籼稻以及模式植物拟南芥基因组序列功能相关研究，分子克隆和DNA多态性研究也较为突出；2007-2010年间研究热点集中在蛋白测定以及利用生物信息技术手段研究核酸序列/蛋白序列的相似性和同源性；2005-2010年间蛋白识别研究一直是研究热点；2011-2014年间围绕大豆、玉米、高粱基因序列开展了大量研究，围绕水稻性状全基因组、评估基因组图谱开展了系列研究，还将GBS技术、MEGA4、Blast2GO广泛应用于作物育种研究。
6.合作关系分析
本研究对发文量前20的机构进行基于“Keyword Plus”中使用的短语的互相关图谱分析，以发现研究机构在研究方向上的相关性以及其竞争性。结果表明，中国科学院在研究内容上与中国农业大学、中国农业科学院、浙江大学、山东农业大学、华中农业大学和日本国立农业生物资源研究所具有较大的相关性；日本国立农业生物资源研究所则与中国科学院、南京农业大学、华中农业大学在研究内容上具有较大相似性；加州大学戴维斯分校与浙江大学和南京农业大学在研究内容具有较大的相似性；南京农业大学还与日本国立农业科研机构在研究内容上
7. 小结
（1）作物育种领域2005-2014年发文量呈稳步增长的态势，其中中国在该领域研究的发展尤为突出。
（2）我国科研机构在作物育种研究水平方面仍有较大提升空间，不同科研机构间在作物育种领域展开了广泛的合作，对促进作物育种研究的发展将产生积极的影响。
（3）作物育种领域主要研究热点包括基于水稻、大豆、高粱、番茄等基因组序列开展的研究，研究还涉及各种作物的多种性能指标的数量性状位点（QTL）识别与分析、分子标记辅助选择、基因连锁图谱等，力图提高作物的非生物胁迫耐受性、抗病性、产量以及营养品质。
（北京市农林科学院农业科技信息研究所报道）
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